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Curso ( 05/02/2016 - 12/02/2016 )
Al final de este curso, los estudiantes serán capaces de:- Describir y comprender el contexto genético del DNA barcoding- Identificar especies a partir de una secuencia dada mediante la realización de consultas en bases de datos e interpretar los resultados- Calcular distancias genéticas e interpretar los resultados- Evaluar críticamente estudios que utilizan la metodología de DNA barcoding- Sintetizar los conocimientos sobre el DNA barcoding de manera efectiva en proyectos, propuestas de subvención, etc.
El DNA barcoding es un método que usa un segmento corto de DNA parala identificación y descubrimiento de especies. El curso de DNA Barcodingproporcionará a los estudiantes una comprensión básica de esta metodología. Las unidades del curso cubrirán conocimientos teóricos del DNA barcoding y análisis e interpretación de resultados, culminando con una visión de las aplicaciones.El curso estará enfocado en animales, aunque los fundamentos y la metodología del DNA barcoding son prácticamente los mismos para todos los organismos.
Programa
Sesión teórica (3,5h) 16:00-19:30- Introducción. Limitaciones de la taxonomía tradicional y origen del DNA barcoding- Componentes de un proyecto barcoding: especímenes, análisis de laboratorio, bases de datos y análisis de datos- Bases de datos: BOLD y GenBank- Distancias genéticas. ¿Existe realmente el barcoding gap?- Limitaciones del DNA barcoding. Taxonomía integrativa.- Aplicaciones del DNA barcoding. Estudio de casos prácticos.
Sesión práctica en ordenador (3,5h) 16:00-19:30- Análisis de cromatogramas, edición de secuencias, BLAST,- bases de datos: BOLD y GenBank, alineamiento de secuencias, cálculo de distancias genéticas, construcción de árboles filogenéticos, análisis del barcoding gap.
DURACIÓN TOTAL DEL CURSO: 7 horas
Docencia: Ainara Achurra (UPV-EHU)
Graduados o alumnos de último curso de Biología, Biotecnología,Bioquímica y Biología Molecular, técnicos de laboratorio, investigadores, personal de la Administración relacionado con la Gestión Medioambiental, personal de Museos, etc.
febrero 2016
5 feb 2016
12 feb 2016
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Curso
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